Sejarah Gampong Gapuy berawal dari kedatangan seorang perantau yang berasal dari Jabal Gafur, wilayah Sigli (Kabupaten Pidie). Pada masa itu, masyarakat Aceh masih sering melakukan perpindahan tempat tinggal untuk mencari lahan yang lebih subur, sumber air yang memadai, serta wilayah yang aman untuk membangun kehidupan baru. Perjalanan tersebut dilakukan melalui jalur darat dan pesisir hingga akhirnya rombongan pendatang menemukan sebuah kawasan di wilayah yang kini dikenal sebagai Kecamatan Lhoong, Kabupaten Aceh Besar.
Setelah tiba di kawasan tersebut, mereka melihat bahwa daerah itu memiliki tanah yang subur, dekat dengan pantai, dialiri sungai kecil, dan dikelilingi perbukitan yang dapat menjadi sumber hasil hutan. Kondisi alam tersebut sangat mendukung untuk bercocok tanam, berkebun, menangkap ikan, serta membangun permukiman. Oleh karena itu, mereka memutuskan menetap dan membuka hutan secara bertahap menjadi lahan pertanian dan tempat tinggal.
Sebagai bentuk penghormatan terhadap kampung halaman yang mereka tinggalkan, masyarakat pendatang kemudian memberi nama permukiman baru tersebut \\\"Gapuy\\\", mengikuti nama daerah asal mereka, yaitu Jabal Gafur di Sigli. Nama itu terus dipertahankan hingga sekarang sebagai identitas gampong dan menjadi pengingat akan asal-usul leluhur masyarakat.
Seiring berjalannya waktu, jumlah penduduk semakin bertambah. Pendatang dari daerah lain juga mulai menetap dan berbaur dengan masyarakat yang telah lebih dahulu tinggal di sana. Mereka membangun meunasah sebagai pusat ibadah, musyawarah, pendidikan agama, dan kegiatan sosial kemasyarakatan. Nilai-nilai gotong royong, kebersamaan, dan adat istiadat Aceh menjadi landasan dalam kehidupan sehari-hari.

Adapun pendapat lain, Masyarakat menyebutkan bahwa gapuy itu ibarat pulau ditengah daratan yang ada di pesisir laut, karena dahulu tidak ada jalur akses untuk menuju gampong gapuy yang hanya bisa di lalui oleh jalur setapak , dan pada masa penjajahan kolonial belanda mereka sangat susah untuk menuju gampong gapuy karena akses yang tidak bisa dilalui oleh kendaraan pada masa tersebut

Mata pencaharian masyarakat pada awalnya didominasi oleh sektor pertanian, perkebunan, dan perikanan karena letak Gampong Gapuy berada di kawasan pesisir. Hingga kini, sebagian besar masyarakat masih menggantungkan hidup pada hasil pertanian dan sumber daya alam yang ada di sekitarnya. Gampong Gapuy juga terus berkembang melalui pembangunan infrastruktur, pendidikan, pelayanan pemerintahan, serta pemberdayaan masyarakat.

Saat ini, Gampong Gapuy merupakan salah satu gampong di Kecamatan Lhoong, Kabupaten Aceh Besar, yang terus berupaya mempertahankan nilai-nilai adat, budaya, dan semangat kebersamaan warisan para pendahulu. Meskipun mengalami berbagai perubahan seiring perkembangan zaman, masyarakat tetap menjaga sejarah asal-usul gampong sebagai bagian dari identitas dan kebanggaan bersama.